Kết luận thanh tra của Thanh tra Chính phủ chỉ rõ dự án xây dựng hạ tầng khu du lịch sinh thái Tràng An đã hết thời hạn thực hiện từ năm 2023 nhưng vẫn dang dở, với các sai sót bao gồm quy hoạch chồng lấn, thiếu đồng bộ, dự án nhóm A không được đưa ra Hội đồng nhân dân tỉnh (HĐND tỉnh) lấy ý kiến, và Ủy ban nhân dân tỉnh (UBND tỉnh) xác định sai nguồn vốn ngân sách Trung ương.
Thanh tra Chính phủ kết luận Dự án xây dựng cơ sở hạ tầng Khu du lịch sinh thái Tràng An tại Ninh Bình đã vi phạm nghiêm trọng trong việc lập và phê duyệt quy hoạch chồng lấn, thiếu đồng bộ; dự án nhóm A nhưng không trình Hội đồng nhân dân tỉnh thảo luận; và việc xác định tăng tổng mức đầu tư từ ngân sách Trung ương mà không có cơ sở pháp lý, dẫn tới mất cân đối vốn.
Thanh tra Chính phủ kết luận Ủy ban nhân dân (UBND) tỉnh Ninh Bình đã điều chỉnh Dự án xây dựng Bệnh viện Sản nhi tỉnh Ninh Bình vượt tổng mức đầu tư nhưng không tổ chức thẩm định lại, đồng thời vẫn phê duyệt sử dụng vốn trái phiếu Chính phủ khi chưa có ý kiến của cơ quan Trung ương và chưa trình Hội đồng nhân dân tỉnh.
Sở Xây dựng Quảng Bình (cũ) đã tham mưu Ủy ban Nhân dân tỉnh Quảng Bình (cũ) ban hành Văn bản chấp thuận chủ trương đầu tư (số 912/UBND) vào ngày 26/5/2017 đối với Dự án Khu nhà ở thương mại phía Tây Nam đường Lý Thánh Tông, vi phạm quy định pháp luật do chưa có ý kiến đồng ý của Hội đồng Nhân dân tỉnh.